从原理上讲两者不应该有太大区别，EPS (Encapsulated PostScript) 和 PDF 都是使用 PostScript 语言来描述矢量的，而矢量之外的「附加部分」的实现应该也是类似——毕竟两者都是 Adobe 推出的格式。

两者的区别在一些「附加功能」上，而这些功能，和 AutoCAD 导出来的图着实已经没有太大关系了。

如果使用虚拟打印出来的 EPS 和 PDF 会有不同——比如说其他一些回答者提到的断线——很可能是因为使用的虚拟打印驱动不知为何对两种格式采取了不同的处理算法。其实，如果要出的图还要放到 Photoshop / AI 中后期处理，而不是直接在 AutoCAD 的布局界面中就办妥一切用于打印（比如施工图），强烈建议直接将文件存成版本相对较低的 DWG, 比如 AutoCAD 2007 的格式，然后直接用 AI 打开这个文件来编辑。

这样，所有图层信息都会在 AI 中得以保留，编辑为便利。在 AI 中处理到差不多了——比如将不同的色块都先分图层填好——再导到 PS 中深化效果（AI 和 PS 都是自家人，图层信息自然也能继承），会方便得多，效果也更容易做得干净。